Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
VPS72Q15906 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VPS72Q15906 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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