Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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