Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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HTR4Q13639 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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HTR4Q13639 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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HTR4Q13639 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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HTR4Q13639 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
HTR4Q13639 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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