Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
FOXE3Q13461 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
FOXE3Q13461 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms