Protein–RNA interactions for Protein: Q12840

KIF5A, Kinesin heavy chain isoform 5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF5AQ12840 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
KIF5AQ12840 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
KIF5AQ12840 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms