Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
EPHB4P54760 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms