Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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HOXD10P28358 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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