Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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USP18Q9UMW8 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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