Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SH3BP4Q9P0V3 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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