Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms