Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SYCP1Q15431 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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