Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
EXOSC2Q13868 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms