Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms