Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms