Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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