Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.78□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
HOXD10P28358 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
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