Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
VPREB1P12018 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms