Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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USP29Q9HBJ7 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
USP29Q9HBJ7 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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