Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms