Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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USF2Q15853 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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USF2Q15853 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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