Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
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