Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NEUROD1Q13562 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms