Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
TCOF1Q13428 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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TCOF1Q13428 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TCOF1Q13428 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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