Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTPRMP28827 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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