Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GTF3C6Q969F1 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GTF3C6Q969F1 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms