Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
EXOSC2Q13868 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.9 ms