Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
AP3B2Q13367 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
AP3B2Q13367 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms