Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
HOXD10P28358 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
HOXD10P28358 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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