Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms