Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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UBXN4Q92575 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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UBXN4Q92575 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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UBXN4Q92575 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
UBXN4Q92575 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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