Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RTL8BQ17RB0 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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RTL8BQ17RB0 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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RTL8BQ17RB0 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RTL8BQ17RB0 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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