Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PIEZO2-210ENST00000580640 8334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms