Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CDH8-203ENST00000577390 9721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ADAM22-205ENST00000398209 9144 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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RYR3Q15413 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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RYR3Q15413 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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RYR3Q15413 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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RYR3Q15413 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RYR3Q15413 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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