Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PGGT1BP53609 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PGGT1BP53609 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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