Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
MIS18AQ9NYP9 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms