Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
FSCN1Q16658 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms