Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SYCP1Q15431 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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