Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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CHD4Q14839 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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CHD4Q14839 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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CHD4Q14839 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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CHD4Q14839 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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CHD4Q14839 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CHD4Q14839 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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