Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
SMCO1Q147U7 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SMCO1Q147U7 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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