Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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