Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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TRIM28Q13263 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
TRIM28Q13263 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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