Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
FOXF1Q12946 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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FOXF1Q12946 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
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FOXF1Q12946 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXF1Q12946 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXF1Q12946 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXF1Q12946 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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FOXF1Q12946 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
FOXF1Q12946 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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