Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRBP23467 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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PTPRBP23467 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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PTPRBP23467 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
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PTPRBP23467 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
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PTPRBP23467 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
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PTPRBP23467 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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PTPRBP23467 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRBP23467 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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