Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Upk1bQ9Z2C6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms