Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx1Q9WV80 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx1Q9WV80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms