Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx4Q9QY61 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx4Q9QY61 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms