Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PHRF1Q9P1Y6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHRF1Q9P1Y6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms