Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GGA3Q9NZ52 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms