Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms