Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RNF39Q9H2S5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF39Q9H2S5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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